연봉제 하의 초과근로수당 청구 가능 여부

명목상 연봉제를 채택하고 있는 제조업체(주40시간제 적용사업장)의 관리사무직입니다.

근로계약서에는 근로시간이 주당 40시간, 급여는 연봉 3천만원을 12개월로 나눈 월250만원(세전)을 지급한다고 되어있습니다.

추가근로시간이 기본적으로 몇시간 임금에 포함되어 있다는 등의 언급은 별도로  없습니다.

그러나 주당 40시간만을 근무하는 것은 절대 아니고 주당 10시간 이상의 잔업, 특근이 있는데

2년을 넘게 근무했지만 한번도 잔업,특근수당을 받은 적이 없고, 쓰지않은 연차수당도 받은 적이 없습니다.

관례상 관리사무직에게는 초과근무수당을 거의 안주는 것이 당연시되는 상황이고 그런 수당을 요구했을시

실직이나 취업이 안되는 등 불이익을 당하는 경우가 다반사라 울며 겨자먹기로 다니고 있습니다.

회사 취업규칙에 보면 관리사무직은 평일 2시간의 잔업을  포함하여 20시까지를 기본근로시간으로 정해놓았던데

이것은 상위법인 근로기준법에 위배되는 것이라 유효한 것이 아니겠지요?

매일 출퇴근카드를 찍기에 출퇴근카드 본사본을 확보하고 있어서 근무시간은 증명이 가능합니다.

월급명세서에는 기본급 1,748,076원, 차량유지비 200,000원, 시간외수당 551,924원 이렇게 총 2,5000,000원(세전)으로 되어 있습니다.

노동청에 진정하면 초과근무수당 및 연차수당을 받을 수 있을런지요?

받을 수 있다면 수당계산시 시간당통상임금 산정은 어떻게 되는지 알고싶습니다.