포괄임금제 적용에 의한 적용 근로시간

저는 포괄임금제를 적용하고 있는 사업장에서 근무하다 지난 11월 20일 횡령관련 항목에 의해 불명예퇴직을 하였습니다. 이에 아래와 같은 사항에 문의 있습니다.

1. 퇴직금은 정산될 수 있을까요? 현재 예상으로는 퇴직금을 회사내 예치하여 저를 고소하든 합의를 진행하든 방향을 정하려고 하는 것 같습니다.  이는 꽤 긴 시간이 소요될 것으로 예상됩니다. 관련하여 퇴직금 정산을 우선 받을 수 있는지 문2. 의 드립니다.

2. 초과근무수당 수령 가능 여부 : 저희 회사는 야근에 대해 인정하지 않기 위해 포괄임금제를 적용하여 야근 수당을 급여에 포함하여 계산하고 있습니다. 하지만 저 개인적으로 근무일자나 시간을 볼때 오전 8시~ 오후 11시까지 근무한 일수가 거의 한달에 10일 이상이며 11시까지는 아니더라도 8~10시까지의 야근은 일반적인 상황입니다.  포괄근무에 포함되는 연장 근무는 주당 12시간을 넘길 수 없는 것으로 되어 있지만 그보다 더 근무한 초과근무에 대한 수당은 제가 청구할 수 있는게 아닌지 하여 문의 드립니다. 대략 계산하여 보건데 월 총합 초과근무시간은 약 50~80시간은 될 것으로 보입니다.

3. 퇴직금 정산시 연월차 수당은 통상임금에 포함되는 것인지 궁금합니다. (2014년 미지급 연차와 2015년 발생 연차를 1년치 통상임금에 포함시켜 계산을 하는 게 맞는지 아니면 제외시키고 12개월 급여를 통상임금으로 하는 것이 맞는지 문의드립니다)

4. 연차사용 권고 : 회사에서는 주기적으로 연차 사용에 대한 권고 및 안내 메일을 발송하고 있습니다만 과도한 업무를 수행한 저희 입장에서는 사용 불가능한 경우입니다. 계속 근무의 경우 연차는 소멸되어 지는데 이는 위반사항이 아닌지 문의 드립니다.